MR600D针对水稻小花ChIP实验的超声打断测试
一、实验基本信息
• 实验日期:2026年7月15日
• 实验设备:MR600D 非接触式超声波破碎仪
• 实验样本:水稻小花(减数分裂期)
• 实验耗材:Axygen1.5ml离心管(MCT-150-L-C)
• 检测方法:2% 琼脂糖电泳
二、样品制备
本次实验样本是水稻小花,各取样大致0.5g,参考aChIP方法(Zhang, Q.,et al.Nat. Plants10, 1317–1329 (2024).)制备A和B两种样品,取900ul各分装为3管样品,具体如下:
样品编号 | 总体积 | 分装 | 对应管号 |
A | 900μL | 300 μL × 3支 | A10、A20、A30 |
B | 900μL | 300 μL × 3支 | B10、B20、B30 |
三、超声处理参数
• 循环模式:30 / 30 s ;单轮总时间设置600 s
• 超声振幅:60%
• 预冷温度:4℃
四、取样安排
第一轮超声结束,取出A10和B10;
第二轮超声结束,取出A20和B20;
第三轮超声结束,取出A30和B30;
五、核酸纯化电泳图
六、测试结论
1、第一轮超声结束后,片段依旧过大;
2、第二轮超声结束后,片段均大致小于600bp;
3、第三轮超声结束后,片段峰值约位于250bp。