实验报告:超声破碎细胞核实验-MR600D对比Q800R3
实验日期:2026年5月15日
实验背景:前期实验都是基因组DNA打断测试,这次测试使用1.5mL样品管架搭配 Axygen 品牌1.5mL低吸附离心管(货号MCT-150-L-C)探究超声破碎细胞效果。同时,非常感谢十院科研团队提供Qsonica品牌Q800R3同MR600D超声仪一同做对比测试。
实验目的:本实验旨在通过蛋白质免疫印迹技术,对比两款超声仪器以及探究MR600D超声仪设置不同超声振幅(20%、30%、40%)对AGS胃癌细胞裂解效果的影响。重点考察各条件下“核蛋白(以组蛋白HISTONE3为标志物)”的释放效率,以确定最佳的细胞核破碎工艺参数。

二、实验材料与设备
2.1 细胞样本
• 细胞系:AGS(人胃腺癌细胞系)。
• 共制作5管样品,每管体积300μL,每管细胞总量30万个细胞
2.2 实验分组与处理条件
实验共设置5个处理组,具体裂解/破碎条件如下:
1. RIPA组:仅使用RIPA裂解液处理(作为基准对照)。
2. 5-20%组:使用5楼Q800R3超声仪,设定振幅为20%。
3. 3-20%组:使用3楼MR600D超声仪,设定振幅为20%。
4. 3-30%组:使用3楼MR600D超声仪,设定振幅为30%。
5. 3-40%组:使用3楼MR600D超声仪,设定振幅为40%。
2.3 检测指标
• 目标蛋白:HISTONE3(组蛋白H3),分子量约15kDa。作为细胞核完整性及核蛋白提取效率的特异性标志物。
• 内参蛋白:ACTIN(肌动蛋白),分子量约40-42kDa。用于校正上样量,确保各组间总蛋白加载一致。
2.4实验耗材:Axygen 1.5mL离心管(型号MCT-150-L-C)
2.5 实验设备:两台非接触式超声波破碎仪(MR600D和Q800R3)
2.6 超声设置
功率设置:20%振幅(以及30%和40%)
循环时间设置:超声15s/暂停15s。
总时长设置:600秒。
2.7 循环冷水机:MR600D使用Huber品牌循环冷水机;Q800R3使用自带半导体循环冷水机,均默认预冷4℃

三、结果分析
3.1 内参蛋白表达情况
• 观察IB: ACTIN条带(下图),所有泳道(RIPA, 5-20%, 3-20%, 3-30%, 3-40%)的条带亮度基本一致,无明显差异。
• 结论:各实验组的上样量均一,排除了因加样误差导致的结果偏差,保证了后续目标蛋白比较的可靠性。
3.2 目标蛋白表达情况
• 观察IB: HISTONE3条带(上图),不同处理组之间存在显著差异:
◦ RIPA组:条带信号最弱,表明单纯化学裂解未能有效破坏细胞核,核蛋白释放极少。
◦ 5-20% vs 3-20%:在相同振幅(20%)下,3楼MR600D(3-20%)产生的HISTONE3信号明显强于5楼Q800R3(5-20%)。
◦ 3楼MR600D梯度变化:随着振幅从20%增加至30%再到40%,HISTONE3条带亮度逐渐增强。3-40%组显示出最强的信号强度,表明该条件下核破碎最为彻底。
四、结论
4.1 超声破碎对核膜通透性的影响
HISTONE3主要存在于细胞核内。RIPA组信号微弱证实了常规裂解液难以完全破坏核膜。引入超声物理破碎后,HISTONE3信号显著增强,说明超声产生的空化效应和剪切力有效破坏了核膜结构,促进了核蛋白向胞浆的释放。
4.2 仪器效能差异分析
在同等低振幅(20%)条件下,3楼MR600D的裂解效率优于5楼Q800R3。
4.3 振幅与提取效率的量效关系
对于3楼MR600D,实验呈现出明显的剂量依赖性:振幅越高(能量输入越大),HISTONE3释放越多。
• 20% -> 30%:信号有显著提升。
• 30% -> 40%:信号进一步增强至峰值。 这表明在该实验体系下,提高超声振幅是提升核蛋白得率的有效手段。但需注意,过高的振幅可能导致蛋白变性或产生过多热量,需结合后续功能实验验证蛋白活性。