实验报告:MR600D超声仪打断基因组DNA的时间梯度实验

实验日期: 2026年1月31日
实验目的:
1. 检测记录不同超声处理时间后DNA片段峰值。
2. 探究不同超声处理时间(5、10、15、20、25、30、45、60分钟)对DNA打断效果的影响。
一、样本准备
本次实验使用原始样品 B2601,其初始浓度为 76.2 ng/μL。
为了进行时间梯度实验,配制了两种不同设定浓度的打断样品,体积均为120μL。
样品编号 | 设定浓度 | 设定体积 | 加原始样品 | 补加 1×TE | 对应序号 |
1 | 10 ng/μL | 120 μL | 16 μL | 105 μL | 1 |
T1 | 20 ng/μL | 120 μL | 32 μL | 88 μL | T1 |
二、超声打断条件
所有样品均使用相同的超声参数,仅改变超声打断时间。
• 超声设置: 20%振幅, 15秒开/15秒关 (15/15s) 循环模式。
三、时间梯度分组
将配制好的样品分为两组,分别进行不同时间的超声处理,获取(序号1-8 和 T1-T8)共16管样本,后续进行片段质检。
超声时间 | 总时间设置s | (组1) | (组2) |
5 min | 600 | 1 | T1 |
10 min | 600 | 2 | T2 |
15 min | 600 | 3 | T3 |
20 min | 600 | 4 | T4 |
25 min | 600 | 5 | T5 |
30 min | 600 | 6 | T6 |
45 min | 1800 | 7 | T7 |
60 min | 1800 | 8 | T8 |
*注:总时间设置是指每一轮超声时设定的总时间秒数
四、后续检测计划
• 检测方法: 使用 Qsp400 (Qsep400毛细管电泳仪) 进行检测。
• 检测顺序: 先检测第一组样品(1-8),根据结果情况再决定是否检测第二组样品(T1-T8)。

详细检测报告可在“技术服务-下载文件”中查看下载对应标题PDF文件
样品序号4检测结果如下图,片段峰值在279bp
