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MR600D超声仪打断基因组DNA的时间梯度实验

来源: | 作者:boyi | 发布时间: 2026-02-02 | 33 次浏览 | 🔊 点击朗读正文 ❚❚ | 分享到:



实验报告:MR600D超声仪打断基因组DNA的时间梯度实验


 

 

实验日期: 2026年1月31日

实验目的:

1.       检测记录不同超声处理时间后DNA片段峰值。

2.       探究不同超声处理时间(5、10、15、20、25、30、45、60分钟)对DNA打断效果的影响。

一、样本准备

本次实验使用原始样品 B2601,其初始浓度为 76.2 ng/μL

为了进行时间梯度实验,配制了两种不同设定浓度的打断样品,体积均为120μL。


样品编号

设定浓度

设定体积

加原始样品

补加 1×TE 

对应序号

1

10 ng/μL

120 μL

16 μL

105 μL

1

T1

20 ng/μL

120 μL

32 μL

88 μL

T1


二、超声打断条件

所有样品均使用相同的超声参数,仅改变超声打断时间。

        超声设置: 20%振幅, 15秒开/15秒关 (15/15s) 循环模式。


三、时间梯度分组

将配制好的样品分为两组,分别进行不同时间的超声处理,获取(序号1-8 和 T1-T8)共16管样本,后续进行片段质检。

超声时间

总时间设置s

(组1)

 (组2)

5 min

600

1

T1

10 min

600

2

T2

15 min

600

3

T3

20 min

600

4

T4

25 min

600

5

T5

30 min

600

6

T6

45 min

1800

7

T7

60 min

1800

8

T8

*注:总时间设置是指每一轮超声时设定的总时间秒数

 

四、后续检测计划

        检测方法: 使用 Qsp400 (Qsep400毛细管电泳仪) 进行检测。

        检测顺序: 先检测第一组样品(1-8),根据结果情况再决定是否检测第二组样品(T1-T8)。




详细检测报告可在“技术服务-下载文件”中查看下载对应标题PDF文件

 



样品序号4检测结果如下图,片段峰值在279bp