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MR600D超声仪打断基因组DNA实验(振幅20%)

来源: | 作者:boyi | 发布时间: 2026-01-20 | 24 次浏览 | 🔊 点击朗读正文 ❚❚ | 分享到:



MR600D超声仪打断基因组DNA实验(振幅20%)

实验日期: 2026年1月16日

实验时间: 14:00

实验目的: 在特定超声条件下,研究不同超声时间对DNA片段化的影响。

 



实验设备与材料:

        超声破碎仪型号: MR600D

        样本管: Axygen品牌低吸附离心管,货号(MCT-060-L-C)

        实验温度: 4℃

        实验材料: 新鲜全血组织基因组DNA


 

一、 实验设置

本次实验设置了两个样本(B0001 和 B0005),并在特定的超声条件下进行处理。

        超声条件:

      振幅: 20%

      循环模式 (On/Off): 15秒开 / 15秒关

      总时间设置:3600s(1800s+1800s)

      中途离心: 在1800s时进行一次离心,避免样品飞溅在管壁上影响超声。

      中途不取样:所有样品待超声结束后统一取样送检

 

        样本信息:

      样本 B0001:

      原始浓度: 106 ng/μL

      原始体积: 60 μL

      总质量: 6.36 μg

      样本 B0005:

      原始浓度: 98 ng/μL

      原始体积: 60 μL

      总质量: 5.88 μg

 

二、 样本配制

将原始样本稀释至目标浓度和体积。

项目

样本 B0001

样本 B0005

原始浓度

106 ng/μL

98 ng/μL

取样体积

60 μL

60 μL

加TE总体积

550 μL

550 μL

超声样品浓度

10 ng/μL (≈10.6 ng/μL)

10 ng/μL (≈9.8 ng/μL)

分装体积

100 μL/支,共6支

编号1-6

100 μL/支,共6支

编号7-12

 

三、 超声打断与取样记录

对两个样本进行超声处理,在两个1800s超声程序结束后,对1-12支样品管各取样10ul进行片段检测。

设定总时间

超声时间

样本 B0001

样本 B0005

备注

1800s

15 min

1-6

7-12

混匀离心一次再超声

1800s

30 min

1-6

7-12

 结束后统一取样

 

四、 备注

        由于移液误差,最后加注6号和12号样本管时,样本体积不足100ul,实际样品体积均为65μL左右。

 

 

 

 

详细检测报告可在“技术服务-下载文件”中查看对应标题PDF文件

 

五、 实验结论

新鲜全血基因组DNA样品打断测试,100ul以及60ul(编号6和12)全部样本打断结果片段大小一致,峰值都在200bp内。

峰值没有精确到个位数原因:超声打断时样品飞溅到管壁上,没有得到更有效超声,导致峰值误差。