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徐钛二号超声仪原型机-DNA打断测试(振幅60%)

来源: | 作者:boyi | 发布时间: 2025-12-09 | 24 次浏览 | 🔊 点击朗读正文 ❚❚ | 分享到:


徐钛二号超声仪原型机超声打断DNA条件优化实验







 

实验报告:徐钛二号超声仪原型机超声打断DNA条件优化实验

实验日期: 2025年12月8日

实验目的: 对比不同超声功率下,对基因组DNA进行片段化处理的效果,以确定最佳打断条件。本次实验主要测试高功率(振幅60%)条件下的打断效率。

实验背景: 本次实验与2025年12月6日的实验条件基本一致,旨在对比不同超声振幅(功率)对同一样本打断效果的影响。

实验设备与参数:

        超声破碎仪

      本次参数: 振幅 60% (约540W)

      上次对比参数: 振幅 20% (约250W)

        样本: 沿用上次实验(2025年12月6日)的样本 A00132 和 A00121。

一、 样本准备

为确保实验可比性,将两个原始浓度不同的样本调整至特定终浓度。

项目

样本 A (A00132   B1D1)

样本 B (A00121   B1D1)

原浓度

49.6 ng/μL

133 ng/μL

原体积

≈ 60 μL

≈ 40 μL

取样体积

48 μL

36 μL

终体积

120 μL

120 μL

补加1×TE体积

72 μL

84 μL

终浓度

20 ng/μL

40 ng/μL

二、 超声打断与取样计划

对配制好的两个样本进行超声处理,并在不同时间点取样,以监测DNA片段大小的变化。

超声时间

样本 A 取样编号

样本 B 取样编号

备注

5 min

1

2

取样5μL

10 min

3

4

取样5μL

20 min

5

6

取样5μL

30 min

7

8

取样5μL

60 min

9

10

取样5μL

120 min

11

12

取样5μL

180 min

13

14

取样5μL

三、 实验结果与后续分析

        分析方法: 所有取样点样本将使用 Qsep400 生物片段分析仪进行片段大小分析。

        实验状态记录:

      样本13 & 14: 在进行180分钟(3H)超声时,已按计划在120分钟时更换了新管,避免样品管破损漏液。

      样本状态: 图片中贴有两个离心管,分别标记为“12-8, 13, 3H”和“12-8, 14, 3H,破损”,样本B原始样本管破损导致14号样品丢失,无法检测。




详细检测报告可在“技术服务-文件下载”中下载对应标题PDF文件



四、 结论

本实验通过设置高功率(振幅60%)超声条件,并对两个不同浓度的DNA样本进行长时间(最长3小时)的时间梯度打断,旨在获得一组完整的DNA片段化数据。通过与低功率(振幅20%)实验结果的对比,可以评估功率对打断效率和片段分布的影响,从而为后续实验确定最佳的超声参数。


从检测结果可以判断:

1,振幅60%和20%超声打断DNA结果一致,无明显差距,即振幅20%在DNA打断处理中能领已然足够,片段大小主要和超声时间线性相关

2,最长超声3H,片段峰值在100bp,这已然到了该设备打断的极限大小