徐钛二号超声仪原型机超声打断DNA条件优化实验
实验报告:徐钛二号超声仪原型机超声打断DNA条件优化实验
实验日期: 2025年12月8日
实验目的: 对比不同超声功率下,对基因组DNA进行片段化处理的效果,以确定最佳打断条件。本次实验主要测试高功率(振幅60%)条件下的打断效率。
实验背景: 本次实验与2025年12月6日的实验条件基本一致,旨在对比不同超声振幅(功率)对同一样本打断效果的影响。
实验设备与参数:
• 超声破碎仪
◦ 本次参数: 振幅 60% (约540W)
◦ 上次对比参数: 振幅 20% (约250W)
• 样本: 沿用上次实验(2025年12月6日)的样本 A00132 和 A00121。
一、 样本准备
为确保实验可比性,将两个原始浓度不同的样本调整至特定终浓度。
项目
样本 A (A00132 B1D1)
样本 B (A00121 B1D1)
原浓度
49.6 ng/μL
133 ng/μL
原体积
≈ 60 μL
≈ 40 μL
取样体积
48 μL
36 μL
终体积
120 μL
补加1×TE体积
72 μL
84 μL
终浓度
20 ng/μL
40 ng/μL
二、 超声打断与取样计划
对配制好的两个样本进行超声处理,并在不同时间点取样,以监测DNA片段大小的变化。
超声时间
样本 A 取样编号
样本 B 取样编号
备注
5 min
1
2
取样5μL
10 min
3
4
20 min
5
6
30 min
7
8
60 min
9
10
120 min
11
12
180 min
13
14
三、 实验结果与后续分析
• 分析方法: 所有取样点样本将使用 Qsep400 生物片段分析仪进行片段大小分析。
• 实验状态记录:
◦ 样本13 & 14: 在进行180分钟(3H)超声时,已按计划在120分钟时更换了新管,避免样品管破损漏液。
◦ 样本状态: 图片中贴有两个离心管,分别标记为“12-8, 13, 3H”和“12-8, 14, 3H,破损”,样本B原始样本管破损导致14号样品丢失,无法检测。
详细检测报告可在“技术服务-文件下载”中下载对应标题PDF文件
四、 结论
本实验通过设置高功率(振幅60%)超声条件,并对两个不同浓度的DNA样本进行长时间(最长3小时)的时间梯度打断,旨在获得一组完整的DNA片段化数据。通过与低功率(振幅20%)实验结果的对比,可以评估功率对打断效率和片段分布的影响,从而为后续实验确定最佳的超声参数。
从检测结果可以判断:
1,振幅60%和20%超声打断DNA结果一致,无明显差距,即振幅20%在DNA打断处理中能领已然足够,片段大小主要和超声时间线性相关
2,最长超声3H,片段峰值在100bp,这已然到了该设备打断的极限大小