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上海仁东医学检验所试用Bioruptor Pico核酸剪切仪

来源: | 作者:1 | 发布时间: 2017-06-08 | 428 次浏览 | 分享到:

比利时 Diagenode公司Bioruptor Pico核酸剪切仪试用概述

 

 

 

试用日期:20174

试用单位:上海仁东医学检验所

试用详情:

Sample volume: 100 µl

Tubes: 0.65 ml Bioruptor® Microtubes (Cat. No. C30010013)

Tube holder:  0.65 ml tube holder & tube adaptor for Bioruptor® Pico (Cat. No. B01200010) for 12 x 0.65 ml tubes

DNA concentration:  10 ng/µl

Sonication buffer: TE (10 mM Tris, 1 mM EDTA), pH 7.5 - 8.0

Target size:200bp

Sonication cycles: 13 cycles (30 sec ON/OFF)

试用结果:

样品品质良好,超声效果理想,同时客户这边正好有竞争品牌M220的保存数据,对比结果基本一致,集中度也不分伯仲,大家的一贯印象是由于M220必须使用高昂的原厂样品管,同时一次只能处理一个样品,在集中度方面绝对更胜一筹,包括我们公司同事也或多或少如此认为,可惜大家都错了!

Bioruptor pico这次证明了它自己是最棒的,对此误解同事们由衷地感到有些内疚。

 检测源数据

 

20170421仁东检验所.pdf

 

20170421仁东检验所Pico-M220.pdf

 

 

 

 

 

 

 

 

 

仪器正在预冷……

 

朱老师正在用毛细管电泳仪检测……

 

 

结果分析:以211这个样品为例来分析

 

样品211,目的片段200bp,按照厂家参考循环数13 cycles (30 sec ON/OFF),峰值稍稍拖后,故在此基础上猛地增加超声循环数5 cycles (30 sec ON/OFF),同时更换了marker后,检测结果请看下图。

 

 

covaris M220保存数据如下图:

 

 

211样品与竞争产品covaris M220保存数据整合对比图如下:

 

红色是之前某B样品的covaris M220保存数据,蓝色是211样品的Bioruptor pico超声18 cycles (30 sec ON/OFF)的检测数据。浓度方面211样品比较高,集中度方面两者差不多。蓝色211样品的波峰往前倾,存在明显的过度超声, 由此判断循环数在13-15 cycles (30 sec ON/OFF)区间即可。