上海博谊生物科技有限公司​
SHANGHAI BOYI BIOTECHNOLOGY CO.,LTD.
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上海伯豪生物试用Bioruptor Pico核酸剪切仪

来源: | 作者:1 | 发布时间: 2017-06-08 | 569 次浏览 | 分享到:

比利时 Diagenode公司Bioruptor Pico核酸剪切仪试用概述

 

Biorupter打断条件测试-2017.5.18.pdf

试用日期:2017年5月

试用单位:上海伯豪生物

试用详情:

Sample volume: 100 µl

Tubes: 0.65 ml Bioruptor® Microtubes (Cat. No. C30010013)

Tube holder:  0.65 ml tube holder & tube adaptor for Bioruptor® Pico (Cat. No. B01200010) for 12 x 0.65 ml tubes

DNA concentration:  0.1-10 ng/µl

Sonication buffer: TE (10 mM Tris, 1 mM EDTA), pH 7.5 - 8.0

Target size:150-1000bp

Sonication cycles: 按照厂家参考循环数

 

 

 仪器已经预冷,陈老师准备样品……

 

 

 

结果分析:

DNA concentration:  1ng/µl

Target size:150bp

Sonication cycles: 30 cycles (30 sec ON/OFF)

试用结果:样品品质良好,超声效果理想。三个样品由于实际浓度有差别,所以波峰有高低。总体上波峰稍稍拖后。Pico仪器是市面上唯一一款60KHz的超声波破碎仪,片段极限在70bp。熟悉DNA打断实验的都知道,目的片段越小、浓度越高越难处理。之前在新培晶试用时,由于浓度太高(50 ng/µl),导致超声时间过长,效果一般。链接:http://www.boyibio.cn/news/html/?89.html

 

 

 

DNA concentration:  红1 ng/µl和蓝20ng/ul两个样品

Target size:250bp

Sonication cycles: 8 cycles (30 sec ON/90 sec OFF)

试用结果:样品品质良好,超声效果理想。厂家推荐浓度是(1-20ng/ul),在此范围内超声效果基本上是不变的。

 

 

 

DNA concentration:  2ng/µl

Target size:300bp

Sonication cycles: 6 cycles (30 sec ON/OFF)

试用结果:样品品质良好,超声效果理想。

 

 

 

DNA concentration:  红2ng/µl(有误),蓝10ng/µl,绿2ng/µl,青0.2ng/µl

Target size:400bp

Sonication cycles: 6 cycles (15 sec ON/90sec OFF)

试用结果:样品品质良好,超声效果理想。浓度方面应该有误,不影响分析,总的来说,超声重复性理想,青0.2ng/µl浓度太低没有检测到。

 

  

 

DNA concentration:  红1ng/µl,蓝9ng/µl

Target size:1000bp

Sonication cycles: 8 cycles (5sec ON/90sec OFF)

试用结果:样品品质良好,超声效果理想。波峰明显小于1kb,超声循环数需要减少1-2个循环。