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比利时 Diagenode公司Bioruptor Pico核酸打断仪处理FFPE核酸样品

比利时 Diagenode公司Bioruptor Pico核酸打断仪处理FFPE核酸样品 

试用日期:20183

试用单位:上海华测艾普医学检验所

试用详情:

Sample volume: 100 µl

Tubes:美国Axygen 0.6ml低吸附离心管(货号:MCT-060-L-C)和Qubit  Assay Tubes

Tube holder:  0.65 ml tube holder & tube adaptor for Bioruptor® Pico (Cat. No. B01200010) for 12 x 0.65 ml tubes

DNA concentration:  10 ng/µl

DNA typeFFPE

Sonication buffer: TE (10 mM Tris, 1 mM EDTA), pH 7.5 - 8.0

Target size:200bp

Sonication cycles: 13 cycles (30 sec ON/OFF)

 

 

 

仪器正在预冷……

 

厂家推荐循环数:

 

样品超声后毛细管电泳系统检测结果:

结果分析:

本次试用主要检测Bioruptor Pico处理FFPE核酸样品的性能,同时简单做一下样品管的对比实验。

 

6个样品是厂家推荐使用美国Axygen 0.6ml低吸附离心管,后6个随手使用的是Qubit测试管。

明显可以看出前6个样品的打断效果正常,对于Bioruptor Pico核酸打断仪,处理FFPE核酸样品没有任何压力。

 

6个样品没有达到目的片段大小,打断效果不理想。

为什么Qubit测试管为何效果不好

首先该测试管品质好,透光性好,可惜由于测试管比较软,导致结果不理想。

关于样品管的选择在此反复申明一下——选择样品管,越薄越硬越好,反之越厚越软越差,管子干嘣脆,结果好的一片跪。

 

 

 

 

 

 

 
 
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